Micropholis Barcodes view Grant

abstract

  • Many species are difficult to identify in the absence of reproductive traits and in juvenile stages. As a result, we may underestimate the biodiversity of the ecosystems where these species grow that is an impediment to management and conservation decision making. Here we present data in which we argue that the generation of DNA barcode reference libraries using DNA extracted from type specimens could resolve issues related to correct identification. The genus Micropholis (Griseb.) Pierre (Sapotaceae) is diverse and ecologically important in Neotropical lowland rain forests. We first assessed the capacity of the molecular markers ITS2, matK and rbcL in differentiating species in the genus. Based on a phylogenetic reconstruction we found that many individuals in our study were incorrectly identified and we explain that if we had access to a type specimen DNA barcode reference library we would have more rapidly and accurately identified individuals. This approach could be extended to other difficult to identify taxa.
  • Muchas especies son difíciles de identificar en ausencia de rasgos reproductivos y en las etapas juveniles. Como resultado, podemos subestimar la biodiversidad de los ecosistemas donde crecen estas especies, lo cual es un impedimento para la toma de decisiones de gestión y conservación. Aquí presentamos datos en los que argumentamos que la generación de bibliotecas de referencia de códigos de barras de ADN utilizando ADN extraído de especímenes tipo podría resolver cuestiones relacionadas con la correcta identificación. El género Micropholis (Griseb.) Pierre (Sapotaceae) es diverso y ecológicamente importante en los bosques tropicales de las tierras bajas. Primero evaluamos la capacidad de los marcadores moleculares ITS2, matK y rbcL para diferenciar las especies del género. Basándonos en una reconstrucción filogenética, descubrimos que muchos individuos de nuestro estudio fueron identificados incorrectamente y explicamos que si tuviéramos acceso a una biblioteca de referencia de códigos de barras de ADN de un tipo, habríamos identificado individuos con mayor rapidez y precisión. Este enfoque podría extenderse a otros taxones difíciles de identificar.

date/time interval

  • 2015-09-01 - 2018-01-01

keywords

  • DNA barcoding
  • DNA libraries
  • Micropholis
  • Sapotaceae
  • barcoding
  • biodiversity
  • decision making
  • ecosystems
  • genetic markers
  • lowland forests
  • phylogeny
  • rain forests
  • reproductive traits
  • type collections