El Doctorado en Ciencias Naturales forma, desde una visión amplia de las ciencias naturales, investigadores capaces de plantear y desarrollar propuestas construidas sobre fundamentos teóricos sólidos, y preguntas y estrategias pertinentes para la resolución de necesidades locales, regionales y globales. El proceso formativo incluye la fundamentación teórica con un mínimo de asignaturas obligatorias con amplia flexibilidad y un énfasis mayoritario en el desarrollo de competencias y habilidades prácticas en investigación. El doctorado integra múltiples visiones producto de la diversidad del cuerpo docente, siendo atractivo para investigadores en formación de múltiples carreras afines a las ciencias naturales.