Esta investigación desarrolló un modelo computacional basado en dinámica de fluidos para el análisis hemodinámico de la enfermedad arterial coronaria, caracterizando el impacto de la morfología de la estenosis y la fisiología microvascular sobre índices diagnósticos como la reserva fraccional de flujo (FFR). Se implementó un solver para las ecuaciones de Navier-Stokes, mediante elementos finitos de igual orden, estabilizado con términos SUPG/PSPG/LSIC y penalización de backflow, utilizando FEniCSx y PETSc para la resolución paralela. El modelo se validó con benchmarks estándar. Las geometrías arteriales parametrizadas, con estenosis de severidad y pendiente variables, se acoplaron a árboles microvasculares sintéticos generados según la ley de Murray. Los resultados mostraron que un modelo de ecuaciones estructurales que integra la reducción de área relativa y la severidad de la estenosis predice el FFR con R2 = 0.85, mientras que la resistencia microvascular no mostró una correlación significativa (p = 0.98), explicando menos del 0.01 % de su varianza. Se identificaron zonas de bajo esfuerzo cortante (< 4 dyn/cm2) en regiones post-estenóticas y bifurcaciones, condiciones pro-aterogénicas. Se concluye que bajo las condiciones evaluadas el FFR está dominado por la geometría de la estenosis, y que la caracterización morfológica cuantitativa proporciona una base para modelos predictivos del diagnóstico funcional.