Simultaneous detection of Plasmodium vivax dhfr, dhps, mdr1 and crt-o resistance-associated mutations in the Colombian Amazonian region Academic Article

journal

  • Malaria Journal

abstract

  • ANTECEDENTES:La malaria sigue siendo un problema de salud pública en todo el mundo. Plasmodium vivax es la especie que causa el mayor número de casos de malaria en Asia y América del Sur. Debido a la falta de una vacuna antipalúdica completamente eficaz, el control de esta enfermedad se ha basado en el manejo de los vectores de transmisión, el diagnóstico rápido y el tratamiento adecuado. Sin embargo, la resistencia de los parásitos a los medicamentos antipalúdicos se ha convertido en un reto importante que aún no se ha superado. El objetivo de este estudio fue determinar las mutaciones y haplotipos de los genes pvmdr1, pvdhfr, pvdhps y pvcrt-o a partir de muestras de campo obtenidas de un área endémica de la región amazónica colombiana.MÉTODOS:Cincuenta muestras de ADN de parásitos infectados por una sola cepa de P. vivax de pacientes sintomáticos del departamento de Amazonas en Colombia fueron analizadas por PCR y los genes pvdhfr, pvdhps, pvmdr1 y pvcrt-o fueron secuenciados. Se calcularon estimadores de diversidad a partir de las secuencias y se obtuvieron los haplotipos que circulan en la región amazónica colombiana.CONCLUSIÓN:Los genes pvdhfr, pvdhps, pvmdr1 y pvcrt-o en la región amazónica colombiana se caracterizan por su baja diversidad genética. Se encontraron algunas mutaciones asociadas a la resistencia circulando en esta población. También se están notificando nuevas variantes. Se localizó una señal de barrido selectivo en los genes pvdhfr y pvmdr1, lo que sugiere que estas mutaciones (o algunas de ellas) podrían estar proporcionando una ventaja adaptativa.
  • BACKGROUND: Malaria continues being a public health problem worldwide. Plasmodium vivax is the species causing the largest number of cases of malaria in Asia and South America. Due to the lack of a completely effective anti-malarial vaccine, controlling this disease has been based on transmission vector management, rapid diagnosis and suitable treatment. However, parasite resistance to anti-malarial drugs has become a major yet-to-be-overcome challenge. This study was thus aimed at determining pvmdr1, pvdhfr, pvdhps and pvcrt-o gene mutations and haplotypes from field samples obtained from an endemic area in the Colombian Amazonian region.METHODS: Fifty samples of parasite DNA infected by a single P. vivax strain from symptomatic patients from the Amazonas department in Colombia were analysed by PCR and the pvdhfr, pvdhps, pvmdr1 and pvcrt-o genes were sequenced. Diversity estimators were calculated from the sequences and the haplotypes circulating in the Colombian Amazonian region were obtained.CONCLUSION: pvdhfr, pvdhps, pvmdr1 and pvcrt-o genes in the Colombian Amazonian region are characterized by low genetic diversity. Some resistance-associated mutations were found circulating in this population. New variants are also being reported. A selective sweep signal was located in pvdhfr and pvmdr1 genes, suggesting that these mutations (or some of them) could be providing an adaptive advantage.

publication date

  • 2018/3/27

edition

  • 17

keywords

  • amazonian
  • colombian
  • mutations
  • pvdhfr
  • pvdhps
  • pvmdr

International Standard Serial Number (ISSN)

  • 1475-2875

number of pages

  • 9

start page

  • 130