Caracterización genómica y de susceptibilidad a los antibióticos de aislamientos colombianos de Campylobacter jejuni causantes de enfermedad diarreica aguda y los asociados con el síndrome de Guillain-Barré captados por la vigilancia nacional
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Campylobacter jejuni, a Gram-negative, spiral-shaped bacillus, is a major cause of foodborne infections and acute gastroenteritis in humans worldwide. This bacterium usually causes moderate to severe watery diarrhea, sometimes with blood, which is usually self-limiting. However, infection with this bacterium can also be associated with complications such as bacteremia and post-infectious immune disorders such as Guillain-Barré syndrome (GBS), which causes significant neurological sequelae and even death.Currently, antibiotic treatment is not recommended for campylobacteriosis, except for immunocompromised patients, in whom an increasing number of C. jejuni isolates with decreased susceptibility to antibiotics is reported, leaving little or no treatment options. This problem highlights the potential risk of campylobacteriosis for public health.The difficulty in culturing this microorganism and the lack of adequate diagnostic methods may be the main causes of the underestimation of the impact of campylobacteriosis (in terms of incidence and prevalence) in several countries. In addition, the limited availability of epidemiological and genomic data on C. jejuni, mainly in South American countries, hinders a comprehensive understanding of the natural history of the infection and impedes the understanding of the processes of transmission and spread of antibiotic resistance markers in this enteric bacterium. Whole genome sequencing emerges as one of the key tools to obtain information about the ability of C. jejuni to colonize, infect and adapt to human and animal hosts, as well as to identify associations between populations of this pathogen and the severity of the clinical pictures it produces, which are related, for example, to increased hospitalization rates, longer hospital stays and various clinical complications.Thus, the objective of this work is to characterize the genome and antibiotic susceptibility profiles (ciprofloxacin, erythromycin and tetracycline) of C. jejuni in Colombia from isolates recovered from patients with acute diarrheal disease in a retrospective approach and from patients with GBS through a prospective component. This study will therefore contribute with Colombian data to the local and global epidemiology of the disease caused by C. jejuni, providing information about the genomic characteristics and antibiotic susceptibility profiles of this pathogenic species in the country, as well as in the generation of future tools to optimize the prevention, diagnosis and treatment of this infection.
Campylobacter jejuni, un bacilo Gram negativo en forma de espiral, es una de las principales causas de infecciones transmitidas por el consumo de alimentos, así como de gastroenteritis aguda en humanos en todo el mundo. Esta bacteria suele causar diarrea acuosa de moderada a grave, a veces con sangre, que es regularmente autolimitada. Sin embargo, la infección por esta bacteria también puede estar asociada con complicaciones como la bacteriemia y trastornos inmunitarios post-infecciosos como el síndrome de Guillain-Barré (SGB), el cual ocasiona importantes secuelas neurológicas e incluso la muerte.En la actualidad, no se recomienda tratamiento antibiótico para la campilobacteriosis, excepto para pacientes inmunocomprometidos, en quienes se reporta cada vez con mayor frecuencia un aumento en el número de aislamientos de C. jejuni con susceptibilidad disminuida a los antibióticos, quedando escasas o inexistentes opciones de tratamiento. Esta problemática deja en evidencia el riesgo potencial de la campilobacteriosis para la salud pública.La dificultad en el cultivo de este microorganismo y la falta de métodos diagnósticos adecuados pueden ser las principales causas de la subestimación del impacto de la campilobacteriosis (en términos de incidencia y prevalencia) en varios países. Además, la limitada disponibilidad de datos epidemiológicos y genómicos sobre C. jejuni, principalmente en países de Sur América, dificulta la comprensión integral de la historia natural de la infección e impide entender los procesos de transmisión y de propagación de marcadores de resistencia a los antibióticos en esta bacteria entérica. La secuenciación de genomas completos surge como una de las herramientas clave para obtener información acerca de la capacidad de C. jejuni para colonizar, infectar y adaptarse a hospederos humanos y animales, así como para identificar asociaciones entre las poblaciones de este patógeno y la gravedad de los cuadros clínicos que produce, que se relacionan por ejemplo con el incremento en las tasas de hospitalización, estancias hospitalarias más prolongadas y diversas complicaciones clínicas.De esta manera, el objetivo de este trabajo es caracterizar el genoma y los perfiles de susceptibilidad a los antibióticos (ciprofloxacina, eritromicina y tetraciclina) de C. jejuni en Colombia a partir de aislamientos recuperados de pacientes con enfermedad diarreica aguda en un enfoque retrospectivo y de pacientes con SGB a través de un componente prospectivo. Este estudio permitirá, por lo tanto, contribuir con datos colombianos a la epidemiología local y global de la enfermedad causada por C. jejuni, aportando información acerca de las características genómicas y de perfiles de susceptibilidad a los antibióticos de esta especie patógena en el país, así como en la generación de futuras herramientas para optimizar la prevención, el diagnóstico y el tratamiento de esta infección.
