Development of a Multilocus Sequence Typing (MLST) strategy for the molecular characterization of seven intestinal parasites view Grant

abstract

  • La diversidad genética de patógenos como virus, bacterias, hongos, protozoos y helmintos representan un ítem relevante en la comprension de las enfermedades causadas por estos microorganismos. Sin embargo, en la actualidad para algunos patógenos eucariótas no existen marcadores moleculares que permitan entender la diversidad, estructura genética y por ende la biología de patógenos eucariotas diploides como los parásitos intestinales protozoarios y helmintos. En este orden de ideas se hace imperativa la búsqueda de marcadores moleculares que permitan evaluar esta diversidad y proporcionar información de la estructura genética de estos patógenos en el país y de igual manera poder compararlos con los de otros países. Por último a la fecha, ni el país ni el mundo cuenta con una base de datos de alelos para patógenos eucariotas diploides como aquellas desarrolladas para bacterias. Por esa razón es necesario llenar éste vacío en el conocimiento de ciencias básicas y construir un portal web que pueda prestar este servicio al país y el mundo entero. Es por esta razón que esta propuesta de investigación se acopla a la convocatoria de Ciencias Básicas de Colciencias la cual busca contribuir al avance de la investigación en ciencias básicas biológicas, físicas, químicas, biomédicas y en matemáticas, que mueva la frontera del conocimiento y que aporte a la generación de productos de nuevo conocimiento de alto impacto. Esta propuesta desea cumplir con el objetivo general de esta convocatoria en el cual como mecanismo de innovación se encuentra la generación de nuevas herramientas para el entendimiento de la biología de los parásitos intestinales en el país así como fortalecer la capacidad investigativa de los grupos de la Universidad del Rosario y Universidad Nacional de Colombia los cuales conjuntamente han venido trabajando en el entendimiento de la estructura genética y poblacional de los parásitos intestinales en el país con productos verificables. Por último, esta propuesta busca la formación de estudiantes de posgrado para complementar los objetivos específicos de esta convocatoria.
  • The genetic diversity of pathogens such as viruses, bacteria, fungi, protozoa and helminths represent a relevant item in the understanding of the diseases caused by these microorganisms. However, at present for some eukaryotic pathogens there are no molecular markers to understand the diversity, genetic structure and thus the biology of diploid eukaryotic pathogens such as protozoan intestinal parasites and helminths. In this order of ideas it is imperative the search of molecular markers that allow to evaluate this diversity and to provide information of the genetic structure of these pathogens in the country and in the same way to be able to compare them with those of other countries. Finally to date, neither the country nor the world has a database of alleles for diploid eukaryotic pathogens such as those developed for bacteria. For that reason it is necessary to fill this gap in the knowledge of basic sciences and build a web portal that can provide this service to the country and the entire world. It is for this reason that this research proposal is coupled to the call for Basic Sciences of Colciencias which seeks to contribute to the advancement of research in basic biological sciences, physics, chemistry, biomedicine and mathematics, which moves the frontier of knowledge and contributes to the generation of new knowledge products of high impact. This proposal wishes to fulfill the general objective of this call in which as a mechanism of innovation is the generation of new tools for understanding the biology of intestinal parasites in the country as well as strengthen the research capacity of the groups of the Universidad del Rosario and Universidad Nacional de Colombia which together have been working on understanding the genetic structure and population of intestinal parasites in the country with verifiable products. Finally, this proposal seeks the formation of graduate students to complement the specific objectives of this call.

date/time interval

  • 2017-01-03 - 2020-01-03

keywords

  • Biological Sciences
  • Colombia
  • Protozoa
  • alleles
  • bacteria
  • chemistry
  • complement
  • diploidy
  • fungi
  • genetic markers
  • genetic variation
  • graduate students
  • helminths
  • mathematics
  • microorganisms
  • multilocus sequence typing
  • parasites
  • pathogens
  • physics
  • viruses