El fuego es un proceso ecológico que puede tener efectos a largo plazo en la estructura y el funcionamiento de los ecosistemas, incluidas las propiedades del suelo y las comunidades microbianas asociadas a las plantas. Esto también ocurre en los ecosistemas de páramo, donde el fuego actúa como una perturbación recurrente. En este ecosistema altoandino, la bromelia endémica Puya goudotiana ha demostrado una alta tolerancia a las temperaturas elevadas. Sin embargo, se desconoce el efecto del fuego sobre la microbiota asociada a las raíces de esta especie. Por lo tanto, evaluamos las comunidades bacterianas y fúngicas en muestras de raíces y suelo circundante de P. goudotiana a lo largo de una cronosecuencia de incendios (incendios en 2002, 1988 y un control sin fuego), utilizando secuenciación de última generación basada en amplicones dirigida a las regiones 16S y 18S rARN, junto con un análisis fisicoquímico de suelos. A largo plazo, el fuego promovió una mayor diversidad bacteriana, pero no tuvo un efecto significativo en las propiedades del suelo ni en la composición de las comunidades bacterianas y fúngicas en comparación con las áreas no quemadas. Además, las comunidades microbianas estaban altamente diferenciadas entre muestras de raíces y suelo circundante. Proteobacteria (~30 %) y Ascomycota (~55 %) fueron los filos más abundantes. No obstante, la conectividad de las redes microbianas aumentó con el fuego. Veinte años después de un incendio, las comunidades microbianas interactuaban de forma más negativa, mostrando patrones de dominancia de bacterias copiótrofas. Sin embargo, casi 40 años después del incendio, las redes mantenían interacciones mayoritariamente positivas entre hongos y bacterias, lo que difería del estado previo al incendio. Destacamos el papel de la severidad del fuego y el clima del páramo en la conformación de las propiedades del suelo y la composición microbiana. Futuros estudios deberían evaluar la funcionalidad microbiana e intervalos de incendios más cortos para comprender mejor la dinámica de recuperación tras incendios.