La pesca en sistemas estuarinos tropicales enfrenta desafíos asociados tanto a la degradación ambiental como a la efectividad de los mecanismos que regulan el acceso, uso y control de los recursos hidrobiológicos. Esta investigación caracterizó la relación entre las prácticas comunitarias de acceso, uso y control del recurso hidrobiológico y la estructura poblacional de la lisa (Mugil incilis) en el municipio de Puebloviejo, Ciénaga Grande de Santa Marta (CGSM). Mediante un enfoque socioecológico, se integraron herramientas participativas (entrevistas semiestructuradas, cartografía social y mapeo de actores) con el análisis biológico de 2.431 individuos y la evaluación de Indicadores Basados en la Longitud (LBI). Los resultados evidenciaron variaciones en los rasgos morfométricos asociadas a la estacionalidad hidrológica, donde el peso total fue la única variable con diferencias estadísticamente significativas (p < 0,05), registrando valores promedio superiores durante el periodo de alta precipitación (142,07 g) frente al de baja precipitación (107,42 g). No obstante, los indicadores de conservación señalaron un estado crítico del stock, caracterizado por una baja proporción de mega-reproductores (Pmega = 0,17) y una captura predominante de individuos inmaduros por debajo de la talla media de madurez (Lmat = 25 cm). Este patrón se asoció con configuraciones locales de acceso funcionalmente abierto, uso extendido de artes de pesca de baja selectividad y mecanismos limitados de control del esfuerzo extractivo. Los hallazgos sugieren que la dinámica de explotación de M. incilis en la CGSM está mediada por la interacción entre selectividad tecnológica, presión sobre corredores migratorios y dinámicas de mercado que sostienen el esfuerzo pesquero independientemente de la estructura de tallas disponible. En este contexto, el análisis integrado de los mecanismos de acceso, uso y control emerge como un componente clave para interpretar las trayectorias de explotación de especies de interés comercial y orientar estrategias de manejo basadas en su estructura poblacional.