La diversificación en el Neotrópico ha sido atribuida en gran medida a la presencia de barreras orográficas, ocasionando que el papel de mecanismos como los gradientes climáticos dentro de unidades geográficas continuas haya sido menormente explorado. El Valle del Magdalena, una región de alta biodiversidad, es una cuenca interandina donde se evidencia una transición climática drástica coincidente con limites biogeográficos reconocidos, lo que podría modular el flujo genético a lo largo del mismo. En este contexto, se evaluó si la variación genética y morfológica de Xiphorhynchus susurrans, un ave con distribución en el valle y sin barreras físicas internas que limiten su dispersión, se asocia con el gradiente climático más que con la distancia geográfica. Se analizaron nueve poblaciones (42 individuos) mediante ddRAD-seq y mediciones de rasgos morfológicos, evaluando la conectividad genética y su relación con la variabilidad climática del Valle del Magdalena. Se identificaron dos grupos a nivel genético y morfológico correspondientes a las ecorregiones del Alto y Medio Magdalena, con una zona de mayor conectividad en la transición del bosque húmedo al seco. El patrón de flujo génico está modulado principalmente por la precipitación anual, de manera independiente la variación de cuatro rasgos morfológicos también mostró correlaciones significativas con el gradiente ambiental del Valle. Estos resultados sugieren que la heterogeneidad climática en valles interandinos puede promover la diferenciación intraespecífica incluso en ausencia de barreras geográficas, patrón consistente con procesos de aislamiento por ambiente (IBE).La diversificación en el Neotrópico ha sido atribuida en gran medida a la presencia de barreras orográficas, ocasionando que el papel de mecanismos como los gradientes climáticos dentro de unidades geográficas continuas haya sido menormente explorado. El Valle del Magdalena, una región de alta biodiversidad, es una cuenca interandina donde se evidencia una transición climática drástica coincidente con limites biogeográficos reconocidos, lo que podría modular el flujo genético a lo largo del mismo. En este contexto, se evaluó si la variación genética y morfológica de Xiphorhynchus susurrans, un ave con distribución en el valle y sin barreras físicas internas que limiten su dispersión, se asocia con el gradiente climático más que con la distancia geográfica. Se analizaron nueve poblaciones (42 individuos) mediante ddRAD-seq y mediciones de rasgos morfológicos, evaluando la conectividad genética y su relación con la variabilidad climática del Valle del Magdalena. Se identificaron dos grupos a nivel genético y morfológico correspondientes a las ecorregiones del Alto y Medio Magdalena, con una zona de mayor conectividad en la transición del bosque húmedo al seco. El patrón de flujo génico está modulado principalmente por la precipitación anual, de manera independiente la variación de cuatro rasgos morfológicos también mostró correlaciones significativas con el gradiente ambiental del Valle. Estos resultados sugieren que la heterogeneidad climática en valles interandinos puede promover la diferenciación intraespecífica incluso en ausencia de barreras geográficas, patrón consistente con procesos de aislamiento por ambiente (IBE).