La microbiota intestinal se define como la comunidad de microorganismos que habitan el sistema digestivo, la cual puede estar sujeta a diferentes interacciones ecológicas, que incluyen benéficas, comensales e incluso patógenas. Los microorganismos con carácter benéfico cumplen con funciones esenciales para el mantenimiento de la homeostasis del hospedero, como: metabolismo de nutrientes, medicamentos y xenobióticos (sustancias químicas exógenas); fortalecimiento de las células epiteliales y de la barrera intestinal; prevención y tratamiento de infecciones por microorganismos patógenos.Debido a la importancia de estos miembros benéficos de la microbiota, es necesario establecer aislamientos, que permitan avanzar en su caracterización genómica que conduzcan a aclarar las bases genéticas de su aporte en el mantenimiento de la homeostasis del hospederos. Para eso, desde el Grupo de Investigaciones Microbiológicas-UR (GIMUR) se avanzará en el establecimiento de aislamientos de bacterias benéficas a nivel intestinal, que serán usados para realizar extracción de ADN. Posteriormente, se verificará la especie estudiada mediante la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) específica. A continuación, se secuenciarán los genomas completos y se realizarán análisis bioinformáticos dirigidos a: ensamblar, anotar y detectar marcadores moleculares de interés en salud. Complementariamente, se evaluará la diversidad y estructura genética a nivel poblacional, con el fin de identificar el efecto de las poblaciones de cada microorganismo benéfico caracterizado. En conjunto, estos hallazgos permitirán avanzar en el conocimiento de la biología de estos microorganismos con potencial biotecnológico, con el propósito de identificar candidatos a probióticos que puedan aportar en el manejo de enfermedades inflamatorias intestinales.
The intestinal microbiota is defined as the community of microorganisms that inhabit the digestive system, which can be subject to different ecological interactions, including beneficial, commensal and even pathogenic.Beneficial microorganisms fulfill essential functions for maintaining host homeostasis, such as: metabolism of nutrients, medications and xenobiotics (exogenous chemical substances); strengthening of epithelial cells and the intestinal barrier; prevention and treatment of infections by pathogenic microorganisms.Due to the importance of these beneficial members of the microbiota, it is necessary to establish isolates that allow progress in their genomic characterization that leads to clarifying the genetic basis of their contribution to the maintenance of host homeostasis.For this, the Microbiological Research Group-UR (GIMUR) will advance in the establishment of isolates of beneficial bacteria at the intestinal level, which will be used to perform DNA extraction.Subsequently, the species studied will be verified using the specific Polymerase Chain Reaction (PCR).Next, the complete genomes will be sequenced and bioinformatics analyzes will be carried out aimed at: assembling, annotating and detecting molecular markers of health interest.Additionally, genetic diversity and structure will be evaluated at the population level, in order to identify the effect of the populations of each characterized beneficial microorganism.Together, these findings will allow us to advance our knowledge of the biology of these microorganisms with biotechnological potential, with the purpose of identifying probiotic candidates that can contribute to the management of inflammatory bowel diseases.
