Identificación de un nuevo factor de riesgo para el desarrollo de cáncer colorrectal en una muestra de afectados del Hospital Universitario Mayor Méderi Abstract

abstract

  • Antecedentes: El cáncer colorrectal (CCR) es un cáncer prevalente, situándose como el tercero más frecuente. Los recientes avances en el conocimiento de las causas moleculares de esta enfermedad han puesto de relieve el papel crucial de la evasión inmunitaria tumoral en su inicio y progresión. CTLA4, un receptor que actúa como regulador negativo de las respuestas de las células T, desempeña un papel fundamental en este proceso, y las variaciones genéticas en CTLA4 se han relacionado con la susceptibilidad al CCR, el pronóstico y la respuesta a la terapia.Métodos: Realizamos un estudio de casos y controles en el que participaron 98 pacientes con CCR y 424 controles. Se genotipificó la variante CTLA4 c.-319C ygt; T (rs5742909) y se realizó un análisis de asociación comparando las frecuencias alélicas entre los pacientes y los controles. Para evaluar el posible impacto funcional de esta variante, primero realizamos un análisis in silico de los sitios de unión a factores de transcripción utilizando Genomatix. Por último, para validar nuestros hallazgos, llevamos a cabo un ensayo de gen reportero de luciferasa utilizando diferentes líneas celulares y un ensayo de cambio de movilidad electroforética (EMSA).Resultados: El análisis de asociación caso-control reveló una asociación significativa entre CTLA4 c.-319C ygt; T y la susceptibilidad al CCR (p = 0,023; OR 1,89; IC 95percent-flag-change = 1,11-3,23). El análisis Genomatix identificó los factores de transcripción LEF1 y TCF7 como ligantes específicos de CTLA4 c.-319C. El ensayo de genes reporteros demostró diferencias notables en la actividad luciferasa entre los alelos c.-319 C y T en las líneas celulares COS-7, HCT116 y Jurkat. El análisis EMSA mostró diferencias en la interacción de TCF7 con los alelos CTLA4 C y T.Conclusiones: CTLA4 c.-319C ygt; T está asociado con la susceptibilidad al CCR. Basándonos en nuestros resultados de validación funcional, propusimos que CTLA4 c.-319C ygt; T altera la expresión génica a nivel transcripcional, desencadenando una mayor regulación negativa de las células T y la evasión tumoral inmune.
  • Background: Colorectal cancer (CRC) is a prevalent cancer, ranking as the third most common. Recent advances in our understanding of the molecular causes of this disease have highlighted the crucial role of tumor immune evasion in its initiation and progression. CTLA4, a receptor that acts as a negative regulator of T cell responses, plays a pivotal role in this process, and genetic variations in CTLA4 have been linked to CRC susceptibility, prognosis, and response to therapy.Methods: We conducted a case-control study involving 98 CRC patients and 424 controls. We genotyped the CTLA4 c.-319C ygt; T variant (rs5742909) and performed an association analysis by comparing allele frequencies between the patients and controls. To assess the potential functional impact of this variant, we first performed an In Silico analysis of transcription factor binding sites using Genomatix. Finally, to validate our findings, we conducted a luciferase reporter gene assay using different cell lines and an electrophoretic mobility shift assay (EMSA).Results: The case-control association analysis revealed a significant association between CTLA4 c.-319C ygt; T and CRC susceptibility (p = 0.023; OR 1.89; 95percent-flag-change CI = 1.11-3.23). Genomatix analysis identified LEF1 and TCF7 transcription factors as specific binders to CTLA4 c.-319C. The reporter gene assay demonstrated notable differences in luciferase activity between the c.-319 C and T alleles in COS-7, HCT116, and Jurkat cell lines. EMSA analysis showed differences in TCF7 interaction with the CTLA4 C and T alleles.Conclusion: CTLA4 c.-319C ygt; T is associated with CRC susceptibility. Based on our functional validation results, we proposed that CTLA4 c.-319C ygt; T alters gene expression at the transcriptional level, triggering a stronger negative regulation of T-cells and immune tumoral evasion.

publication date

  • 2021-11-12

keywords

  • Alleles
  • Binding Sites
  • COS Cells
  • Case-Control Studies
  • Cell Line
  • Colorectal Neoplasms
  • Computer Simulation
  • Electrophoretic Mobility Shift Assay
  • Gene Expression
  • Gene Frequency
  • Genetic Variation
  • HCT116 Cells
  • Immune Evasion
  • Jurkat Cells
  • Luciferases
  • Neoplasms
  • Reporter Genes
  • T-Lymphocytes
  • Therapeutics
  • Transcription Factors
  • Tumor Escape

number of pages

  • 1

start page

  • 1

end page

  • 1