Candida Non-albicans and Non-auris Causing Invasive Candidiasis in a Fourth-Level Hospital in Colombia: Epidemiology, Antifungal Susceptibility, and Genetic Diversity
Academic Article
Increasingly common and associated with healthcare settings, Candida infections are very important, since some species of this genus can develop antifungal resistance. We contribute data on the epidemiology, antifungal susceptibility, and genetic diversity of Candida non-albicans and non-auris affecting critically ill patients in a fourth-level hospital in Colombia. Ninety-seven isolates causing invasive infections, identified by conventional methods over 18 months, were studied. Data from patients affected by these yeasts, including sex, age, comorbidities, treatment, and outcome, were analysed. The antifungal susceptibility of the isolates was determined, and the ribosomal DNA was sequenced. Candida parapsilosis, Candida tropicalis, Candida glabrata, Candida dubliniensis, and Candida guilliermondii caused 48.5percent-flag-change of all cases of invasive candidiasis. The species were mainly recovered from blood (50percent-flag-change). Patients were mostly men (53.4percent-flag-change), between 18 days and 93 years old, hospitalized in the ICU (70.7percent-flag-change). Overall mortality was 46.6percent-flag-change, but patients in the ICU, using antibiotics, with diabetes mellitus, or with C. glabrata infections were more likely to die. Resistant isolates were identified in C. parapsilosis, C. tropicalis, and C. glabrata. This study provides epidemiological data for the surveillance of emerging Candida species, highlighting their clinical impact, as well as the emergence of antifungal resistance and clonal dispersal.
Las infecciones por Candida, cada vez más frecuentes y asociadas a los entornos sanitarios, son muy importantes, ya que algunas especies de este género pueden desarrollar resistencia a los antifúngicos. Aportamos datos sobre la epidemiología, susceptibilidad antifúngica y diversidad genética de Candida no albicans y no auris que afectan a pacientes críticos en un hospital de cuarto nivel en Colombia. Se estudiaron 97 aislamientos causantes de infecciones invasoras, identificados por métodos convencionales durante 18 meses. Se analizaron los datos de los pacientes afectados por estas levaduras, incluidos sexo, edad, comorbilidades, tratamiento y evolución. Se determinó la sensibilidad antifúngica de los aislados y se secuenció el ADN ribosómico. Candida parapsilosis, Candida tropicalis, Candida glabrata, Candida dubliniensis y Candida guilliermondii causaron el 48,5percent-flag-change de todos los casos de candidiasis invasora. Las especies se recuperaron principalmente de la sangre (50percent-flag-change). Los pacientes eran en su mayoría varones (53,4percent-flag-change), tenían entre 18 días y 93 años y estaban hospitalizados en la UCI (70,7percent-flag-change). La mortalidad global fue del 46,6percent-flag-change, pero los pacientes ingresados en la UCI, que tomaban antibióticos, con diabetes mellitus o con infecciones por C. glabrata tenían más probabilidades de morir. Se identificaron cepas resistentes en C. parapsilosis, C. tropicalis y C. glabrata. Este estudio aporta datos epidemiológicos para la vigilancia de las especies emergentes de Candida, destacando su impacto clínico, así como la aparición de resistencia a los antifúngicos y la dispersión clonal.
